国内刊号:11-2201/X
国际刊号:1000-6923
发布日期:
作者:钟文婧, 苏建强, 李虎, 周艳艳
单位:1. 区域与城市生态安全全国重点实验室, 中国科学院城市环境研究所, 福建 厦门 361021;2. 中国科学院大学, 北京 100049;3. 广东省海洋生物技术重点实验室, 汕头大学, 广东 汕头 515063
关键词:插入序列,ISfinder数据库,多样性,功能基因,共现
基金:国家自然科学基金资助项目(42161134002);广东省海洋生物技术重点实验室资助项目(GPKLMB202204)
基于ISfinder数据库,结合文献检索,对5812种插入序列(IS)的多样性及其与功能基因的共现关系进行了系统分析.研究表明,不同IS家族(IS family)在宿主中的分布以及与功能基因的共现特征存在差异.DDE转座酶类型IS占据主导地位,IS5和IS3家族涵盖的IS种类最多,而ISH6最少.IS广泛存在于细菌和古菌中,多个IS家族具有宿主特异性,仅发现于细菌或古菌.进一步分析发现IS与多种功能基因(如抗生素抗性、重金属抗性、应激抗性等)共现,显示出它们在环境适应和微生物抗性基因传播中的重要作用.部分IS具有与多种功能基因共现的特性,展现了更广泛的生态适应性;而另一些IS的共现基因则功能相对专一.实验验证IS在基因传播和宿主适应中的机制是未来研究重点.这不仅有助于理解微生物如何适应环境变化、应对选择压力,还能为抗生素抗性、病原体传播等公共卫生问题提供理论基础,从而为发展新的防控策略和生物技术应用奠定基础.
来源:2025年第4期
《中国环境科学》期刊编辑部